Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc37F8VPK0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc37F8VPK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms