Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8220F6YKI2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms