Protein–RNA interactions for Protein: F6Y363

Gm6665, Predicted gene 6665, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6665F6Y363 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6665F6Y363 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6665F6Y363 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms