Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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