Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngap1F6SEU4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms