Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm340F6RGI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms