Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms