Protein–RNA interactions for Protein: E9QA22

Zfp644, Zinc finger protein 644, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp644E9QA22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp644E9QA22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp644E9QA22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp644E9QA22 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms