Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cald1E9QA15 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms