Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccdc7bE9Q9Y3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc7bE9Q9Y3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc7bE9Q9Y3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ccdc7bE9Q9Y3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms