Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3127E9Q9P5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3127E9Q9P5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms