Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdhr2E9Q7P9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms