Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dnah11E9Q7N9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dnah11E9Q7N9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms