Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Simc1E9Q6E9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms