Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DspE9Q557 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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