Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde8bE9Q4S1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde8bE9Q4S1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms