Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NbasE9Q411 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms