Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r238E9Q373 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms