Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930523C07RikE9Q2T4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930523C07RikE9Q2T4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms