Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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