Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrp3E9Q1T6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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