Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3893E9Q1I1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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