Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms