Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fndc1E9Q043 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fndc1E9Q043 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fndc1E9Q043 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms