Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20425E9Q035 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms