Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4450E9Q007 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm4450E9Q007 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm4450E9Q007 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms