Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ryr1E9PZQ0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms