Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf11E9PZM7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms