Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rsph10bE9PYQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms