Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp4E9PYK3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms