Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5415E9PXF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5415E9PXF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms