Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Abca16E9PWJ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abca16E9PWJ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms