Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms