Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc175E9PVB3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms