Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcn1E9PVA8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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