Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifit3bE9PV48 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifit3bE9PV48 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms