Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU019823E9PUQ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms