Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC035044E0CXF8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035044E0CXF8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms