Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh8D3Z6W3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms