Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms