Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc6D3YZP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms