Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif28pD3YXS5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms