Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc170D3YXL0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms