Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms