Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmf1B9EKI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms