Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apol6B7ZC55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apol6B7ZC55 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms