Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms