Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp26c1B2RXA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms