Protein–RNA interactions for Protein: B2RX14

Zcchc11, Terminal uridylyltransferase 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc11B2RX14 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zcchc11B2RX14 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zcchc11B2RX14 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zcchc11B2RX14 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms