Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm4787B2RUD9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm4787B2RUD9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms